本发明涉及一种用于智能井井下流量控制器的密封结构，包括上阀体、下阀体、内滑套、密封底座、金属密封组件和第三密封环；上阀体的侧壁上设置多个节流孔，下阀体固定连接在上阀体的下端，密封底座固定连接在下阀体的内侧；金属密封组件设置在下阀体的内侧且位于上阀体的下端面与密封底座的上端面之间，金属密封组件和上阀体共同构成供内滑套上下滑动的通道；金属密封组件包括第一密封环和与之配合的第二密封环，第一密封环采用K型金属密封环，第二密封环为非金属弹性密封环，第二密封环的截面为楔形，第二密封环安装在位于K型金属密封环顶部的楔形空间中；下阀体与上阀体之间、下阀体与金属密封组件之间以及密封底座与下阀体之间均设置有第三密封环。