本发明公开了一种冬春季节性干旱条件下小麦玉米轮作保水节肥的方法，该方法通过播种光叶紫花苕和蓝花子、播种小麦、割刈光叶紫花苕和蓝花子植株、覆盖光叶紫花苕和蓝花子植株、收获小麦、翻压光叶紫花苕和蓝花子植株、栽种玉米、玉米施肥和收获玉米等步骤来实现；该方法在小麦季可提高整个小麦生育期种植土壤含水量1.1%，提高小麦生育后期土壤含水量2.3%，利用绿肥紫花苕和蓝花子还田替代玉米种植中施用的28.28%以上的化学氮肥，在减少化学氮肥的同时提高周年产量11.7kg/亩，提高周年经济效益44.66元/亩，该方法充分利用绿肥资源，减少化学肥料的使用，有利于小麦玉米轮作体系的可持续发展，易操作，具有广阔的推广应用前景。