本发明涉及一种基于PCR‑DGGE技术的沙门氏菌分型方法，⑴提取供试样品的DNA，并进行样品编号；⑵以样品基因组DNA为模板，采用引物GC‑rpoB1/rpoB3R扩增样品；⑶PCR产物的变性梯度凝胶电泳分析；⑷DGGE图谱中优势条带的回收与测序；⑸DGGE凝胶条带回收后，筛选阳性克隆测序；⑹采用MEGA5软件，Neighbor‑joining法构建系统发育树。PCR‑DGGE技术具有分离快速简便、重复性好等优点，避免了分离纯化和培养所造成的分析上的误差，通过指纹图谱直接再现菌群结构，并且通过序列分析切下的带或者通过独特的探针杂交鉴定其种类，是一种快速高效的病原微生物分型检测方法。