本发明公开了一种锂电池穿插式电芯及其制造方法，穿插式电芯包括有中间基体、左嵌入体和右嵌入体，中间基体为连续折叠的多层结构，左嵌入体和右嵌入体为多个且为U形折叠的双层结构，左嵌入体包裹于中间基体折叠后的4M+2层和4M+3层外，右嵌入体包裹于中间基体折叠后的4M+3层和4M+4层外，其中，M为大于或等于0的整数。本发明穿插式电芯的截面为矩形，适用于方形铝壳电池，空间利用率得到提高；电芯各处的张力一致，极片不易断裂，内部反应也会更加均匀；且穿插式电芯的制造装置结构简单，制造效率高，使得隔膜、极片的张力波动小。