本发明公开了一种微波辐射水膜式饮用水消毒系统，微波辐射水膜式饮用水消毒系统，包括待消毒水储水间、锯齿型微波散射板、微波腔体、内置流量调节阀、微波散射锥、上部水膜形成板、磁控管支柱、磁控管、下部水膜形成板、已消毒水储水区、外置阀门、壁面，所述微波腔体被所述上部水膜形成板和所述下部水膜形成板分成微波工作区I和微波工作区II，所述待消毒水储水间下部为圆形竖直入水口，所述已消毒水储水区下部为圆形竖直出水口，所述上部水膜形成板由三根吊链悬起，所述下部水膜形成板由三根斜柱支撑。该系统具备微波利用率高、饮用水消毒效果好、磁控管使用寿命长的优点。