本申请提供一种信号接收通道校准方法和磁共振校准系统，所述磁共振校准系统包括射频发送单元、多个硬件结构相同的信号接收通道和控制台计算机，所述方法包括：射频发送单元输出射频信号，输入每个信号接收通道的调理输入端；每个信号接收通道在通过调理输入端接收到射频发送单元输出的射频信号后，对射频信号进行处理，并将处理后的射频信号上传至控制台计算机；控制台计算机在接收到校准模式指令后，接收每个信号接收通道上传的处理后的射频信号，并基于处理后的射频信号和射频发送单元输出的射频信号，确定信号接收通道的增益补偿值和相位补偿值。本申请技术方案可以提高信号接收通道校准的精确度，从而提高最终得到的磁共振图像的图像质量。