本发明公开了一种基于区块链的数据处理系统，系统包括：基础设施层，由门户、客户端和基于对等网络通信的N个服务器组成，每个服务器建立一条区块链的初始区块并维护一条区块链；处理层，用于实现系统应用层和基础设施层数据的交互和处理，该层包括：数据上传模块、单区块验证模块、数据查询模块，以及周期性区块链验证模块中基础设施层各个服务器按周期检验自身维护的区块链的正确性；应用层，用于根据用户的请求调用处理层的模块，并在此层实现访问控制。利用本发明实施例，系统查询数据效率、资源利用率较其他区块链处理系统高。