本发明提供一种多机并联的电池储能系统自适应控制方法和系统，所述方法和系统通过计算每个电池储能系统的初始目标功率，电网的功率需求值，以及根据电池储能系统实时的荷电状态而确定的工作区间和出力状态，确定将处于不出力状态的电池系统的初始目标功率分配给增量出力状态的电池储能系统的出力增量，并最终确定每个单机电池储能系统的出力参考值。本发明实了现多机并联的电池储能系统在充电和放电时对其荷电状态的调整，与现有的虚拟同步机技术相比，针对不同的电池储能单元之间SOC的不同，提出考虑SOC的控制策略，有效解决了多机并联的电池储能系统之间SOC不均衡的问题，同时避免了储能系统的过充和过放。