基于GIS的山地建筑综合体雨水防控与利用系统及方法，该系统包括在园区内地下埋设的专用调蓄池和自然山体蓄水池；所述专用调蓄池包括洁净雨水池和污染雨水池两部分；所述洁净雨水池内设有洁净雨水多功能加压泵，所述污染雨水池内设有污染雨水多功能加压泵等。本发明还包括一种基于GIS的山地建筑综合体雨水防控与利用方法。利用本发明，当降雨量较大，周围山洪冲入山脚处园区内时，可将园区地内雨水尽快控制收纳储存，避免因地面积水过深使建筑物发生水淹的风险，待降雨后将收集的雨水分质进行回用。