本发明提供了一种岩石孔隙度测定方法及系统，其中，装置包括：充气设备、参考室、样品室、绝压测量设备、第一阀门、第二阀门以及第三阀门；充气设备通过第一阀门连接参考室的入口，用于为参考室加压；参考室的出口通过第二阀门连接样品室的入口，用于为样品室加压及提供参考压力；样品室用于容置岩石样品；绝压测量设备设置在参考室上，用于测量大气压及绝对压力；第三阀门设置在样品室的出口，用于调整样品室内压力。本发明能够避免测量过程中大气压变化对压力测定的影响，提高岩石孔隙度测定的准确度。