本发明公开一种电-氢孤岛直流微电网能量管理方法，测量当前时刻电-氢孤岛直流微电网状态；通过分层控制的顶层根据测量数据基于系统经济性及稳定性计算当前时刻各储能系统的最优输出功率参考值；通过分层控制的底层根据功率参考值对各个系统输出功率进行调节，控制蓄电池系统、燃料电池系统、电解槽系统及储氢罐系统的工作模式，完成孤岛直流微电网的能量管理。本发明在保证微电网系统电压稳定、功率平衡的基础上，能够保证系统使用成本最小，能够保证储能元件的储能状态保持平衡，提升了微电网运行的稳定性及经济性。