本发明提供一种辅助病理切片模具构建方法、系统、存储介质、终端，包括以下步骤：基于医学影像数据构建肿瘤的3D模型；构建与3D模型相匹配的主体模型；构建与所述主体模型相匹配的盖子模型；构建与所述主体模型和所述盖子模型相匹配的边框模型；基于所述主体模型、所述盖子模型和所述边框模型生成辅助病理切片模具。本发明的辅助病理切片模具构建方法、系统、存储介质、终端能够构建辅助病例切片模具，以实现术前医学影像与术后病理切片之间的一一对应，从而验证术前医学影像上勾画的肿瘤边界的准确性。