本发明公开了一种ssDNA核酸适配体及其在致病性溶藻弧菌中的应用，所述ssDNA核酸适配体的核苷酸序列为5’-GACGCTTACTCAGGTGTGACTCGCGTTTTATTGGTGTGGGGCTGGGGCGGTGGGTGGCTCTACTGGTTCCGTTCGAAGGACGCAGATGAAGTCTC-3’(SEQ ID No：1)。本发明的ssDNA核酸适配体对卵形鲳鲹源致病性溶藻弧菌具有特异性和高灵敏度，且无免疫原性。该ssDNA核酸适配体结构稳定、易修饰，便于合成和保存，可对卵形鲳鲹源致病性溶藻弧菌进行快速准确的检测和诊断。