本发明提供了一种工控容错服务器在线病毒查杀和病毒防护的方法，包括以下步骤：步骤1：对不同运行环境的容错服务器进行不同的备份操作；步骤2：分析不同生产环境的工控信息管理系统数据服务器端口，判断被生产系统使用的端口和空闲端口；步骤3：选择安全稳定的杀毒软件对系统进行全盘杀毒；步骤4：对通过病毒查杀不能解决问题的，进行进一步处理；本发明能够生产网络工控信息管理系统的系统架构，对处于不同运行环境中的容错服务器进行备份，并区分被系统使用的端口和空闲端口，进而对空闲端口进行封堵，并且能够进行全盘病毒查杀，且不会误删工控信息管理系统文件或容错服务器的AUL系统文件，方便、快捷、实用。