本发明涉及一种脱硫后氮氧化物排放浓度自动控制方法，主PI控制器的两个输入量为脱硫出口NOx设定值和实际测量的脱硫出口NOx，主控制器的输出为脱硝出口NOx设定值，该脱硝出口NOx设定值和实际测量的脱硝出口NOx作为副PI控制器的两个输入量；实际测量的脱硝入口NOx和燃料量共同叠加在主PI控制器和副PI控制器的输出值上。本发明可以应用到SO2、粉尘控制等各种排放浓度控制的工艺中，相对原来单回路控制的方法，明确被控对象，提高调节品质，符合环保相关要求。