本发明公开了一种沼气内燃发电机组的协同优化控制方法及系统，通过基于深信度网络DBN建立沼气内燃发电机组的整体运行模型，采用粒子群算法求解沼气内燃发电机组的协同优化控制模型，最终输出最佳协同优化的空燃比参数和进气量，实现对沼气内燃发电机组的协同优化控制，不仅可提高沼气内燃发电机组的发电效率，而且能提高发电机组的电压输出稳定性和快速负载跟踪能力，更重要的是确保冷热电联供系统和国家电网的安全、稳定、可靠运行，具有十分重要的意义。