本发明提供一种基于花菁结构测钯离子的近红外荧光探针、其制备方法及应用，所述荧光探针的结构式如下：，探针是基于钯离子促进溴丙炔脱保护的机理，该探针以花菁为母体，传感分子释放出花菁染料分子单体，荧光强度显著性增强并伴随明显的颜色变化，用肉眼就可以观察到溶液的颜色变化，选取的干扰离子等对检测效果无影响，因而实现了对钯离子的特应性识别响应，该探针在DMSO/PBS(v/v=8/2,pH=7.4)缓冲体系中对钯离子反应比较迅速，具有良好的选择性和较高的灵敏度，抗干扰能力强，检测限达到52 nM，在生物与环境样品中的钯离子的检测有良好的应用前景。