本发明涉及一种藻水分离舱，包括舱体，舱体内设置絮凝箱、配药箱、初级藻水分离机构、重力过滤机构和压滤机构，配药箱包括絮凝剂配药箱和混凝剂配药箱，絮凝剂配药箱和混凝剂配药箱通过进药管与絮凝箱连通，絮凝箱设置藻水进水管和藻水出水管，藻水出水管设置初级藻水分离机构上侧，初级藻水分离机构包括连接电机的第一滤带输送带和毛刷辊，且初级藻水分离机构下端开设浓藻出口和清水出口，重力过滤机构为第二滤带输送带，浓藻出口设置于第二滤带输送带上方，压滤机构包括第三滤带输送带和压滤带，第二滤带输送带尾端连接末端位于第三滤带输送带上方的导料板，所述藻水分离舱置于水边，实现藻水减容，降低运输成本。