本发明公开了一种并联型有源滤波器的恒功率控制的自抗扰控制系统，包括自抗干扰控制器，自抗干扰控制器包括有微分跟踪器、扩张状态观测器和观测器反馈控制回路，其中微分跟踪器负责滤除忽略的非线性信号的扰动；扩张状态观测器负责采集控制电流和直流侧电压实际值，输出三相有源电力滤波器的状态量和扰动量；观测器反馈控制回路采集直流侧电压参考值和三相有源电力滤波器的状态量和扰动量，生成控制电流反馈给扩张状态观测器；将自抗干扰控制器分别安装在低通滤波器以及直流侧电压处。本发明通过加入了自抗扰控制技术可以通过跟踪微分器滤出外来干扰，并且通过扩张状态观测器估计扰动，从而解决精度不够准确的问题。