本发明涉及一种基于Aza-BODIPY的近红外二窗荧光探针的设计合成与应用，属于有机荧光探针领域。近红外二区染料(NIR-II，1000-1700nm)由于其发射波长较长，光散射和组织自发荧光干扰较少，在生物成像中可获得更好的分辨率和成像深度。Aza-BODIPY类荧光染料拥有较长的吸收发射波长，较窄的半峰宽，较大的摩尔消光系数，被广泛应用于光动力治疗等领域。本发明设计合成的近红外二窗荧光探针结构式如图(I)所示。该探针在经典的Aza-BODIPY结构上引入给电子基团久洛尼定，并增加分子的刚性。该探针具有优越的光稳定性和抗干扰能力。该探针在小鼠成像实验中，成功实现近红外二窗成像。