本发明提供一种光伏发电站健康状态评估方法和系统，方法包括如下步骤：根据光伏发电站所处区域的自然环境计算出其日单位装机的标准发电量；获取光伏发电站日单位装机的实际发电量；根据光伏发电站日单位装机实际发电量与其标准发电量之间的关系，对其健康状态进行评估。本发明提供的光伏发电站健康状态评估方法，根据光伏发电站所处区域的自然环境计算出其单位装机的标准发电量，并根据该标准发电量与光伏发电站实际发电量之间的关系对光伏发电站的健康状态进行评价。由于本发明所提供技术方案所采用的数据量较少，计算过程简单能够解决在对大量接入的光伏发电站的健康状态进行评价时计算过程复杂、工作效率较低的问题。