本发明公开了一种基于视频会议系统的无线辅流数据传输方法，包括以下步骤：根据第一辅流设备中预设的无线配对信息，响应第一辅流设备的无线配对请求并自动更新投屏软件，将第一辅流设备与视频会议主机进行无线配对连接；响应用户操作投屏软件后输入的运行请求，根据运行请求通过第二辅流设备运行投屏软件；通过投屏软件将第二辅流设备的音视频数据传输到视频会议主机，实现无线辅流数据传输。本发明实施例提供了一种基于视频会议系统的无线辅流数据传输方法及系统，能够解决传统辅流设备对音视频接口线缆的依赖与兼容问题，有效地提高了设备使用人员的使用体验，从而提高了视频会议参与者的会议体验。