本发明公开了一种根瘤菌FAMB126及其应用，该菌株系是通过闽花8号花生品种捕捉自福建省安溪地区土壤中的根瘤菌,从新鲜根瘤中对根瘤菌进行分离和纯化，并对菌株的16s rDNA部分序列进行测定，通过系统发育分析，确定为慢生根瘤菌属（Bradyrhizobium）的新菌株系，并命名为福农2号。本发明的根瘤菌FAMB126通过实验室水培回接试验以及大田回接实验证明其具有高效结瘤、固氮能力强的特性，接种该根瘤菌能够提高花生生物量以及产量，可适用于华南酸性土壤，作为花生常规栽培的措施之一。