本发明涉及防腐涂层制备技术，旨在提供一种高耐候水性防腐涂料制备方法。包括：在搅拌条件下，向粒子型纳米SiO2溶胶中加入Al(OH)3溶胶，陈化制得Al(OH)3溶胶包覆的复合二氧化硅溶胶；将无水乙醇与去离子水混合，用盐酸溶液调节pH值，加入KH570和正硅酸乙酯，继续搅拌后加入复合二氧化硅溶胶；混合、研磨后，与醋酸、甲基三甲氧基硅烷混合并搅拌，得到高耐候水性防腐涂料。本发明提高了有机基团与无机纳米相的相容性和反应性，同时通过研磨的方式赋予了无机纳米溶胶离子与预聚物反应基团之间更多的机械能，使其反应程度提高，更充分地相结合，从而提高了涂料的致密性和耐候性。通过本发明的制备工艺，水性涂料的耐候性不变的情况下，提高了水性涂料的耐腐蚀性能。