本发明公开了一种基于外部网络在线等值的全网短路电流分析方法及系统，通过按省级电网并行的方式提高全网在线运行方式短路电流分析的计算速度，在针对省级电网的短路电流分析过程中通过将外部电网等值降低待分析电网规模，提高单个计算任务短路电流分析的计算速度。将全网在线运行方式中的直流系统等值为恒阻抗负荷并确定等值后的交流同步电网；以各交流同步电网中单个省级电网的短路电流分析作为计算任务进行并行计算；根据短路故障所属厂站的区域属性，筛选出省级以上电网调管厂站的短路电流分析结果；通过提高全网短路电流分析的计算速度，满足调度运行控制对在线分析的时效性要求。