本发明创造提供了一种多功能畜牧养殖系统及养殖方法，包括依次从下往上叠加的若干层养殖层，养殖层与养殖层之间设置有用于盛放粪便的粪便托盘，粪便托盘上设置有与其对应的粪便清理装置，每层养殖层包括并排设置的相互独立的养殖笼，养殖层包括机架，养殖笼设置在机架上，机架上设置有滑轨，养殖笼的底部设置有与滑轨相配合的滑块，滑块能够在滑轨上滑动，滑轨与机架的长度方向垂直，滑块滑到滑轨的最里端里，养殖笼位于养殖状态。本发明创造自动化程度高，能够实现自动对禽类实现定时定量的喂养。