本发明涉及一种用于烟草叶面喷施的复合硒肥及在富硒烟叶生产中的应用。该复合硒肥包括以下重量份的组分：亚硒酸钠7～13份，表面活性剂10～15份，胺鲜酯7～13份，富里酸240～260份。本发明的用于烟草叶面喷施的复合硒肥，与直接喷施亚硒酸钠溶液相比，可有效提高烟草的经济性状，显著提高上等烟比例；能最大化改良烟草物理特性，增加可用性；能提高烟草钾含量使化学成分更加协调；能提高新植二烯含量，增加香气浓度，改善香气质量；能显著降低丙二醛含量、提高谷胱甘肽过氧化物酶活性，有效提升烟草抗氧化能力；该复合硒肥对烟草生长和烟草品质的改善较现有硒肥全面提升，可有效应用于富硒烟叶的生产过程中。