本发明属于网络时钟同步技术领域，特别涉及一种基于机器自学习的高精度网络对时同步方法。本发明涉及到网络对时中延时与偏差的分析，特别对于网口延时与网口负载率的关系的分析，加上主端与从端的报文的传输延时和偏差的计算，可以提高网络对时的精确度。本发明在考虑到网络对时同步延时产生的原因，将其分类为网口延时与网络传输延时，针对网口延时，本发明分析了其与网络负载率的关系，对于主端与从端不同负载率的条件下，本发明给出了基于机器自学习的研究方法，使得网口延时的计算更加智能化。本发明在此基础之上给出了主从端时间同步的模型及方法。通过的本发明的实施可以能够实现在不同网络负载率的情况下，主从端时钟的高精度同步。