本发明公开了一种基于河流模拟的季节性河流与地下水间相互作用预测方法，根据河网的特性设计了一种自动确定模拟路径的算法，应用于大型复杂天然/人工河网。本发明中在进行河流编号时是随机的，无需考虑河网的汇流关系和分流关系，方便了用户的工作；同时本发明完善了多河流分流的功能，能够模拟多条河流的定量分流和按比例分流情形，以及可分水量大于或小于总需水量的情形；此外，采用本发明对季节性河流与地下水间相互作用的流量预测具有较高的精确性。