本发明提供了一种风电机组变桨系统高电压穿越控制系统及方法，通过在变桨系统电源模组驱动电源的整流电路中位于充电电阻的前端增加串联了热敏电阻，且通过切换继电器对热敏电阻进行通路/短路控制，并通过交流端电压采集器采集监测变桨系统电源模组驱动电源外部输入的三相交流电源的电压有效值，进而利用交流端电压比较器根据三相交流电源的电压情况控制切换继电器对热敏电阻的通路/短路工况进行切换，联合借助变桨系统中驱动电源、后备电源和备电源管理电路原有的低压保护功能，实现了对风电机组变桨电机驱动模块的高电压穿越控制，技术思路巧妙、系统改造成本和技术难度低，为风电机组中变桨电机驱动模块的高电压穿越控制提供了新的技术思路。