本申请公开了一种氢原子频标微波腔工作频率的控制方法和装置，解决了微波腔振荡信号受探测信号干扰的问题，所述装置包括主动型氢原子频标物理部分，混频器，第一功率分配器，晶振环路，第二功率分配器，锁相倍频电路，腔伺服环路和频率合成电路。所述方法包括利用腔牵引效应对氢原子频标物理部分输出的微波信号进行调制；主动型氢原子频标微物理部分输出的微波信号经过下混频，得到中频信号；中频信号经过幅度检波得到直流信号输出给变容二极管二。本发明无需对微波腔进行微波注入，从而减小了注入微波信号对脉泽振荡信号的干扰；环路中信号频谱纯净，实现整机频率稳定度和相位噪声水平较高；整个装置和方法原理简单、结构小型、易操作。