一种电子内窥镜系统，具备：照射单元，对被摄体依次照射光谱不同的多种照射光；图像信号生成单元，依次拍摄被依次照射有多种照射光的被摄体，并生成通过各照射光照射的被摄体的各系统的图像信号；存储单元，预先存储有规定的校正值；以及分光图像生成单元，基于通过图像信号生成单元生成的各系统的图像信号中的至少两个系统的图像信号来生成分光图像。分光图像生成单元在基于至少两个系统的图像信号来生成分光图像时，基于预先存储在存储单元中的校正值来校正该至少两个系统的图像信号中的至少一个系统的图像信号。