本发明适用于数据处理技术领域，提供了一种动态心电图处理方法及系统，包括：心电记录盒记录每次上电采集开始时根据日志文件中记录的采集开始标志以及采集结束标志判断心电数据是否丢失，并在心电数据丢失时记录掉电标记；使得处理端根据接收到的心电数据和日志文件判断出心电数据存在丢失时，根据心电数据和日志文件得出心电数据中包含的心电数据段以及心电数据段中丢失的数据长度，并对心电数据进行填充得到填充后的心电数据。本发明实施例能对异常掉电时采集到的心电数据进行丢失数据的识别和填充，从而保证了最终得到的得到填充后的心电数据是可以进行正常心电图绘制的完整可用心电数据。