本发明涉及硬质合金技术领域，具体公开一种异质核壳结构复合粉末及其制备方法。所述异质核壳结构复合粉末，以WC为内核、抑制剂为内壳层、粘结相金属为外壳层；所述抑制剂为过渡金属碳化物，所述粘结相金属为Co、Ni、Fe的混合合金；所述抑制剂在所述复合粉末中的质量分数为1.2wt.％～4wt.％，所述粘结相金属在所述复合粉末中的质量分数为3wt.％～15wt.％，所述混合合金中Co、Ni、Fe的质量比为(1-2)：(1-2)：(1-2)。本发明提供的异质核壳结构复合粉末，组织均匀、性能稳定、成分易调节，可通过调整工艺参数，对粉末内核平均粒径、内外壳层厚度及其成分等进行调控，为制备不同晶粒度高性能硬质合金奠定基础。