本发明公开了一种继电保护数据传输系统，该系统包括FPGA接口板卡、仿真器及控制保护装置，FPGA接口板卡部署有仿真接口模块、第一FIFO模块及第二FIFO模块，仿真接口模块接收仿真器发送的一次设备数据，并将一次设备数据以第一预设速率写入第一FIFO模块；第一FIFO模块将一次设备数据以第二预设速率发送给控制保护装置；第二FIFO模块接收控制保护装置以第二预设速率发送的控制保护数据；将控制保护数据以第一预设速率返回给仿真器。应用本发明实施例所提供的技术方案，较大地简化了接线，减小了人身触电意外事故发生的概率，提高了安全性。本发明还公开了一种继电保护数据传输方法，具有相应技术效果。