本发明公开了一种第三代智能变电站开关量就地模块测试系统及其应用方法，测试系统包括机箱和分安装在机箱中的主板模块、HSR报文通讯模块、开入量模块、开出量模块以及电源模块，主板模块包括依次相连的D/A转换模块、HSR报文解析模块、中央处理器和上位机通讯模块，HSR报文通讯模块包括HSR报文发送端口和HSR报文接收端口；应用方法包括采用测试系统对开关量就地模块完成测试。本发明能够对第三代智能变电站开关量就地模块的功能和性能进行自动测试，能够实现开关量就地模块功能和性能的批量自动检测，能够提升智能变电站的检修维护效率、保障电网的安全高效运行。