本发明涉及一种基于PCI总线的二次设备硬件板卡自动识别方法，通过总线号、功能号和设备号等信息区分板卡类型，然后通过识别扫描电路读取板卡寄存器中存储的硬件ID等信息；处理器及各硬件识别电路发送对应硬件板卡的识别ID到数据反馈接口电路；数据反馈接口电路将硬件板卡的识别ID传送到硬件识别控制器，硬件识别控制器集成的识别ID寄存器将分别收集各个硬件板卡的识别ID，并传送到所述二次设备识别控制端，二次设备识别控制端根据上送的不同硬件板卡识别ID分配不同的角色。本发明能够实现硬件通用板卡插件插入二次设备时能自动识别插件类型及功能，自动转换二次设备的类型及应用场景，降低运维工作量和难度。