本发明公开了一种复合型磷氮系无卤阻燃剂及其制备方法和用途，该复合型磷氮系无卤阻燃剂的分子式为C12H29N4O5P3S2，结构式为：其由前体2‑硫代‑2‑氯‑5,5‑二甲基‑1,3,2‑二氧磷杂环己烷与水合肼经过酰胺化反应制得中间体，再与二氯化乙基磷酸反应制得。该阻燃剂能作为纤维素纤维、聚酯纤维、聚氨酯纤维和聚烯烃纤维纺制过程的原料添加物，或作为阻燃涂层的主要功能物。该阻燃剂含不同种类磷元素和富含氮元素，在提高阻燃效率的同时，具有杀菌活性。制备时的反应条件温和，制备方法简单。