本发明提供了一种区域多能源供给系统日内滚动协同优化运行方法和装置，包括以下步骤：S1：分析区域多能源供给系统结构，提取多能源供给系统内的设备运行特性和能流特性，并在此基础上建立系统设备和系统数学模型；S2：基于系统数学建模和当前能源价格信息，构建日前协同优化运行的目标函数，结合日前优化的约束条件，得到区域多能源供给系统日前协同优化运行方案；S3：基于日前协同优化运行方案中的机组启停方案、最近的负荷预测数据和可再生能源发电预测出力，得到日内滚动优化运行方案；S4：基于日内滚动运行方案，求得区域多能源供给系统实时运行方案。本发明所提出方案可以消除预测误差和可在生能源波动的影响，确保系统安全稳定运行。