本发明公开了一种杀菌效果好、消毒废液不污染环境且对人体无害、毒性小、不易损伤苔藓植物的苔藓植物外植体的消毒方法。该消毒方法通过对苔藓外植体清洗后，接着将外植体依次经过酒精、次氯酸钠、酒精、次氯酸钠浸泡消毒处理，然后利用无菌水清洗干净后放入培养皿中，培养14‑21天至培养基表面形成原丝体和茎叶体，剪取培养基表面形成的原丝体和茎叶体，并依次经过酒精、次氯酸钠、酒精、次氯酸钠浸泡消毒处理，最后再利用无菌水清洗干净后即可得到无菌的苔藓外植体，该消毒方法操作简单、所需外植体量少、操作门槛低、不使用高污染消毒剂、对环境无害，试验效果好。适合在植物组织培养技术领域推广应用。