本发明公开了一种利用毛细管电泳荧光SSR指纹图谱鉴别白蜡新品种‘青碧’的方法，是由白蜡幼嫩叶片提取白蜡基因组DNA，并以提取的DNA为模板，利用筛选出的SSR引物对进行PCR扩增，将PCR扩增产物进行毛细管电泳，根据电泳结果中每对SSR引物的峰值，组合形成白蜡新品种‘青碧’的SSR指纹图谱，实现对白蜡新品种‘青碧’的鉴别。本发明方法中利用筛出特异性稳定、多态性好的6对SSR特异引物，构建了白蜡新品种‘青碧’的指纹图谱，能够简便、快速、准确地完成白蜡新品种‘青碧’样品的鉴定。