本发明涉及一种检测软件工程算法组态异常的方法，属于软件技术领域，解决了现有技术组态异常发生率计算不准确、不合理的问题。该方法包括如下步骤：对软件工程算法组态进行分类检测，获得分类检测结果中每一类包含的算法组态总数；识别上述分类检测结果中每一类包含的组态图与功能图不一致的算法组态个数，并分析获得上述不一致对应的严重性等级权重；根据上述分类检测结果中每一类包含的算法组态总数、组态图与功能图不一致的算法组态个数，以及不一致对应的严重性等级权重，获得综合组态异常发生率。该方法通过拆分组态图元素，达到了将组态逻辑量化的效果，并且更新了组态异常发生率的计算方法。