本发明提供一种柔性直流输电系统有功功率控制方法和系统，控制方法的步骤为：当接收到有功功率调整信号后，根据主极控系统/主单元的功率参考值和接收到的有功功率调整值判断换流站的工况；根据接收到的有功功率调整值、各极控系统的功率上限值、功率下限值和功率参考值，计算出换流站在各工况下主极控系统/主单元和从极控系统/从单元的有功功率调整值。本发明所提供的技术方案，针对柔性直流输电系统的控制方式和所处的工况调整主极控系统/主单元和从极控系统/从单元的有功功率调整值，使柔性直流输电系统对有功功率分量调整能够满足控制的需求，提高柔性直流输电系统的可靠性。