本发明公开了一种基于射频指纹的鉴别伪GPS信号方法，包括步骤：(1)发送设备通过多径信道发送GPS信号；(2)接收设备接收GPS信号并进行预处理，得到目标信号；(3)截取目标信号得到待识别信号区间；(4)对待识别信号区间进行射频指纹变换，将经过变换后得到的特征向量作为待识别信号的射频指纹；(5)将待识别信号的射频指纹与射频指纹库中的指纹进行匹配，若有匹配项，则判定该待识别信号为真实信号，否则判定为伪信号。本发明复杂度更低。