本发明公开了一种用于深水区水质净化的生态浮岛，包括框架系统、微循环系统、以及设置于框架系统周围的固定系统；所述框架系统包括外周浮动框架、设置于外周浮动框架中间凹槽内的第一浮台和第二浮台；所述微循环系统纵向贯穿于所述框架系统的中间位置、并使得所述框架系统的圆周外侧下部形成循环复氧涡流。本发明通过设置的框架系统，可同时种植、搭载挺水植物、浮叶植物、沉水植物以及人工水草等，构建出适合于深水区水质净化的植物群落，实现深水区从上至下的立体净化，达到良好的深水区水质净化效果。