本发明公开了一种清管器定位系统及方法，属于油气管道领域。该系统包括：第一压力变送器和第二压力变送器，分别设置在目标管道的上游端部和下游端部。第一信号采集器和第二信号采集器，分别与第一压力变送器和第二压力变送器电连接。信号处理器，同时与第一信号采集器和第二信号采集器连接。电源，用于对第一压力变送器、第二压力变送器、第一信号采集器、第二信号采集器、信号处理器供电。信号处理器从第一信号采集器和第二信号采集器获取上游压力信号和下游压力信号，分别处理为上游压力值和下游压力值，并对两者处理，若两者中均存在预设突变值，信号处理器对清管器进行定位。该系统的定位方法高效、精确、简单，便于实时监测清管器运行状态。