本发明公开了一种光子晶体波导正交分裂模干涉FANO共振结构，其包括由若干个具有折射率的介质柱排布构成的二维光子晶体线型波导，二维光子晶体线型波导包括两个波导端口和一个点缺陷谐振腔，其中两个波导端口分别设置在点缺陷谐振腔的两侧，点缺陷谐振腔包括四个介质柱和一个横截面长边垂直于波导轴且长宽比为2.4～2.6的点缺陷介质柱，其中点缺陷介质柱的两侧相对称地分别设置各两个介质柱，四个介质柱和点缺陷介质柱的各个中心等距离地间隔排布。本发明结构紧凑，便于控制Fano谐振的明模和暗模，易于与其它光子晶体器件实现集成。