本发明适用于数字仿真技术领域，公开了一种机电暂态与电磁暂态混合仿真的接口位置选择方法及系统，包括：删除交直流系统中的直流子系统，得到交流系统；基于交流系统，在换流母线上施加不对称故障，计算每个交流母线在不对称故障下的电压不平衡度，并获取电压不平衡度小于预设阈值的目标交流母线的集合；根据目标交流母线的集合得到目标接口策略的集合，其中，目标接口策略中包含多个目标交流母线；根据预设权重系数，对每个目标接口策略进行评估，得到每个目标接口策略的评估指标；选取评估指标最小的目标接口策略实施机电暂态与电磁暂态混合仿真。本发明能减小在电磁暂态仿真环境中的外部系统等值电路的复杂程度。