本发明提出了基于三维重建的河工测量方法，首先，在水平仪水平板上建立坐标系，标记若干个坐标点；然后将水平仪置于待测地形的任意位置，从多个角度、多个距离拍摄多幅待测地形的照片，且其中至少有10幅照片中包含水平仪；其次将拍摄照片导入visual SFM软件中，在软件中找出含有水平仪的所有照片，在含有水平仪的每张照片中输入标记的坐标点；visual SFM软件通过计算，还原相机拍摄位置，同时根据照片构建待测地形三维模型；最后将待测区域划分网格，并将待测地形三维模型的点插值到划分好的网格点上，得到最终的河工模型。本发明通过庞大数量的点相互校验，提供高精度的测量结果。