本发明提供了一种柔性变电站结构，包括：高压整流单元、高压直流母线及至少一第一低压负载单元，高压整流单元的输入端与配电网高压侧连接，输出端与高压直流母线连接，将高压交流电转换为高压直流电；高压直流母线由多个储能电容串联构成，储能电容存储高压直流电，并为第一低压负载单元进行供电；第一低压负载单元包括：连接本地分布式电源的第一负载单元及至少一不连接本地分布式电源的第二负载单元；第一负载单元与至少一储能电容对应设置，第一负载单元与第二负载单元连接相同的储能电容。实现了为多个直流电压等级负载进行供电，并实现对本地分布式电源多余发电量储能，避免了能源浪费，并可防止配电网馈线末端电压越限，保障末端用户安全。